Głównym celem Centralnej Wojskowej Przychodni Lekarskiej CePeLek SPZOZ jest podejmowanie działań na rzecz ochrony i poprawy stanu zdrowia ludzi poprzez organizowanie i prowadzenie działalności leczniczej, profilaktycznej, stałe podnoszenie poziomu świadczonych usług oraz propagowanie zachowań prozdrowotnych.